В настоящее время проводится комплекс следственных действий, направленных на установление всех обстоятельств произошедшего, принимаются меры по установлению и задержанию лиц, причастных к совершению указанного преступления.
По факту убийства Следственное управление Следственного комитета России по Дагестану возбудило уголовное дело по статьям: «Посягательство на жизнь лица, осуществляющего правосудие или предварительное расследование», «Убийство» и «Незаконный оборот оружия». По основной версии следствия, причиной убийства судьи Верховного суда Дагестана Мухтара Шапиева является его служебная деятельность.
Мухтар Шапиев работал судьей Верховного суда с января 2012 года и занимался гражданскими спорами. По данным представителей Верховного суда Дагестана, убитый не специализировался на уголовных делах или делах, связанных с экстремизмом. Шапиев, до того как был назначен судьей, несколько лет проработал в прокуратуре Дагестана и выступал государственным обвинителем в уголовных процессах. Также до назначения судьей Мухтар Шапиев два года работал прокурором Сергокалинского района.
По мнению коллег убитого, запоминающимся делом было его участие в 2006 году в процессе Магомеда Мухтарова, который обвинялся в организации покушения на мэра Махачкалы Саида Амирова 4 сентября 1998 года. Шапиев стал третьим в списке убитых в 2013 году судей. Напомним, что в январе этого года в Махачкале был расстрелян судья Верховного суда РД, Магомед Магомедов, а в марте возле собственного дома в Избербаше неизвестные убили федерального судью – Ахмеда Раджабова.